PERBANDINGAN PROFIL TOTAL DNA DURIAN (Durio zibethinus Murr) VARIETAS MENOREH KUNING HASIL ISOLASI DENGAN METODE DETERGEN DAN KIT KOMERSIAL

  • Tara Puri Ducha Rahmani Universitas Islam Negeri Walisongo Semarang
    (ID)
  • Budi Setiadi Daryono Universitas Gadjah Mada
    (ID)
  • Ismail Ismail Universitas Islam Negeri Walisongo Semarang
    (ID)
DOI: https://doi.org/10.24252/teknosains.v16i2.29385

Abstrak

Durian (Durio zibethinus Murr) kultivar Menoreh Kuning adalah salah satu plasma nutfah Indonesia yang berasal dari Provinsi Daerah Istimewa Yogyakarta. Pedagang durian umumnya menjual durian dagangannya dengan mengakuinya sebagai Durian Menoreh. Oleh karena itu, untuk mengidentifikasi kultivar Durian Menoreh tersebut diperlukan suatu metode yang akurat, yaitu isolasi DNA sebagai langkah awal. Terdapat beberapa metode isolasi DNA yaitu metode yang menggunakan detergen dan kit komersial. Penelitian ini bertujuan untuk membandingkan profil total DNA Durian Menoreh Kuning hasil isolasi dengan detergen dan kit komersial (NucleonTM PhytopureTM Genomic DNA Extraction Kits) secara kualitatif dan kuantitatif.

               Metode isolasi DNA dilakukan dengan detergen dan kit komersial. Pelet DNA daun Durian Menoreh Kuning dilarutkan dalam 50 µL TE kemudian masing-masing 5 µL sampel dielektroforesis dalam agarose 1% selama 30 menit. Hasil elektroforesis kemudian di-staining dengan ethidium bromide lalu diamati di bawah transluminator-UV. Hasil kedua metode isolasi dibandingkan berdasarkan profil total DNA setelah dielektroforesis dalam 1% agarose, berat pelet (total DNA), dan hasil Optical Density dari DNA tersebut.

                        Hasil penelitian menunjukkan bahwa DNA Durian Menoreh Kuning yang diisolasi dengan detergen dan kit komersial dapat terlihat di bawah transluminator-UV. Berat pelet DNA yang diisolasi dengan detergen adalah 0,004 gram dan yang diisolasi dengan kit komersial adalah 0,0004 gram. Hasil OD untuk DNA yang diisolasi dengan detergen menunjukkan nilai Absorbansi 2,658 AU, Rasio 1,057, konsentrasi 6645,6 µ gr/mL  dan Protein 93,9 milligram/mL. Sedangkan hasil isolasi DNA dengan kit komersial adalah 2,760 AU untuk Absorbansi, Rasio 1,339, konsentrasi 6900,6 µ gr/mL, dan Protein 54,8 milligram/mL. Berdasarkan hasil penelitian dapat diambil kesimpulan bahwa DNA Durian  Menoreh Kuning dapat diisolasi dengan detergen dan kit komersial. Profil DNA yang diisolasi dengan kit komersial menunjukkan hasil yang lebih baik dibandingkan dengan profil DNA yang diisolasi dengan detergen.

Diterbitkan
2022-08-27
Terbitan
Vol 16 No 2 (2022): Mei-Agustus
Bagian
Artikel

This license allows authors to copy, redistribute, remix, transform, and build upon the Work, in any format or medium, for any purpose including commercial purpose, on a perpetual basis provided they credit the Work and the authors. Authors
must explain any changes that were made from the original and may not suggest the authors endorse the use. The resultant work must be made available under the same terms, and must include a link to the CC BY 4.0 International License.

Abstrak viewed = 1390 times